b. biomed-skill

BIOMEDICAL RESEARCH, MADE TANGIBLE v0.5.5

从科学问题,
到可编辑的作品。

把发现写清楚,把数据画明白,把机制解释出来。
14 项技能,沿用你的证据、研究问题与表达方式。

R / PrismHTML / SVGMarkdown / PowerPoint
IDEA → EVIDENCE → OUTPUTEDITABLE SVG
基础配体符号↓Y 型受体二聚体
默认基础版 · 胶囊蛋白

同一份 SVG,
从机制图走到动画。

查看信号传递过程 →
SOURCE-LINKED
EDITABLE BY DESIGN

01 / A CONNECTED WORKFLOW

从问题出发,按产物选技能。

每个入口负责完成一个具体产物。已有的主张、图号、来源与决策,可沿着工作流继续使用。

02 / OPEN THE ACTUAL EXAMPLE

先看作品,再看它怎样完成。

基础版默认使用胶囊蛋白、Y/U 受体与对应二聚体,直接组成完整机制图和动画。

Y 型二聚体→胶囊蛋白+U 型二聚体

INTERACTIVE, SOURCE-LINKED HTML

机制图本身,也是一段解释。

点击后在这里加载完整演示。可直接操作时间轴与对照条件。

独立窗口可完整浏览与导出当前帧

03 / RUNNABLE R EXAMPLES

看得到图,也拿得到数据和代码。

下列 tidyplots 示例由当前源码重跑。使用合成教学数据;50 × 50 mm 为绘图区,PDF 保留完整画布尺寸。

复现:解压完整技能包,在包目录运行 Rscript --vanilla skills/scientific-plotting-tidyplots/examples/run.R my-figures。下载技能及共享辅助文件 →

04 / ONE STUDY, SEVERAL OUTPUTS

同一组证据,怎样走到一份作品?

虚构教学案例:X 敲低降低类器官面积,补回恢复表型,X–Y 相互作用未检出。四位供者的匹配比较。

paper-framing

构思科学故事

中心贡献:Protein X 支持类器官扩增;敲低与补回将生长表型连接到 X 的功能。 概念意义:把表达相关性推进到可干预的生物学依赖。 建议图序:Fig. 1 干预与补回;Fig. 2 机制检验。 提出的 X–Y 结合模型仍可引导下一步实验;当前共免疫沉淀没有检出相互作用。

查看该技能的详细用法 →
FIGURE 1 · 功能发现教学布局
A敲低 · 配对面积
B补回 · 功能特异性
CX蛋白验证 · 待提供图
D待补数据剂量反应与可逆性

图字母与面板分开;缺失证据保留为占位。此图是示意布局,不表示真实读数。

下载填写后的示例计划 ↓

05 / THE COMPLETE FIELD GUIDE

14 个入口,每项都有具体示例。

打开一项技能,查看适用输入、可复制提示词、工作步骤、示例输出和完整源文档。

显示 14 项技能

故事与写作01

构思科学故事

paper-framing

把结果组织成一个值得发表的发现,明确它改变了什么理解。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
故事与写作02

写出发现及其意义

paper-writing

从证据写作或重组标题、摘要、Results、Discussion 和图注。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
故事与写作03

保留科学力度的润色

paper-polishing

改善已有文字的语言与结构,保留原意、科学兴趣和证据层级。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
绘图与组图04

从数据到可编辑图

scientific-plotting

为分组、配对、重复测量、剂量反应、存活和热图选择合适表达。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
绘图与组图05

默认使用 tidyplots

scientific-plotting-tidyplots

保持共享科学与交付标准,以 tidyplots 构造紧凑 R 图。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
绘图与组图06

规划并组装完整图版

figure-plan

把整体图序落实为面板清单、主图/补图 PowerPoint 与整图导出。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
绘图与组图07

交付 Prism 可编辑数据

graphpad-prism

保留原生项目、数据表与图的连接,也可导出明确标注的数据表 PZFX。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
论文与机制08

读清论文的实验逻辑

paper-distill

围绕问题、比较、控制、观察和解释理解论文,并提取可迁移方法。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
论文与机制09

把论证变成证据图

paper-evidence-map

将中心主张、实验、控制和结果组织为可编辑的来源图。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
论文与机制10

让机制可以看见

scientific-visual-explainer

默认用胶囊蛋白、Y/U 受体与二聚体,生成完整机制图和可交互动画。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
方法与交付11

从 Methods 到步骤

paper-to-protocol

将来源明确的方法转成可打印步骤与 Labmate 导入文件。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
方法与交付12

从执行记录写 Methods

protocol-to-methods

根据实际完成的实验写方法,保留偏离原方案的操作。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
方法与交付13

按目标期刊整理投稿

submission-check

从期刊、文章类型和阶段获取当前要求,核对材料并整理文件。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗
方法与交付14

让结果可重建

scientific-reproducibility

保留直接数据、参数、模型、方法记录和可编辑输出。

输入 · 提示词 · 示例 · 文件 ↗

06 / TAKE IT INTO YOUR WORK

下载、安装,
用你自己的问题开始。

网页演示直接在浏览器运行。技能在你的代理环境中使用;R、Prism 或文档工具按任务配置。

Claude Code

claude plugin marketplace add mianaz/biomed-skills
claude plugin install biomed-skill@biomed-skill

Codex / Cursor

下载并解压技能包,将 skills/ 下的完整目录复制到你的技能目录。写作技能需同时保留 biomed-shared/;tidyplots 与 Prism 需保留 scientific-plotting/。

完整安装与用法说明 →
SKILL FIELD GUIDE