Add Visium spatial data to Seurat object
Usage
AddVisiumSpatialData(
seurat_obj,
coords,
visium_data,
h5ad,
assay_name = "Spatial",
verbose = TRUE
)
Arguments
- seurat_obj
Seurat object
- coords
Spatial coordinates
- visium_data
Visium-specific metadata
- assay_name
Assay name
- verbose
Print messages
Value
Modified Seurat object